Al término de la primera fase del campeonato de la Liga 3, los cuatro clasificados de cada grupo a la segunda fase son los siguientes:
Grupo A: Unión Santo Domingo (tendrá 2 puntos de bonificación), Estudiantil CNI (tendrá 1 punto de bonificación), Juventud Cautivo y Unión Huaral.
Grupo B: Universitario B (+2 puntos), Juventus FC (+1 punto), Alianza Lima B y Deportivo Lute.
Grupo C: Construcción Civil (+2 puntos), Nuevo San Cristóbal (+1 punto), Sport Huancayo B y ADT Reserva.
Grupo D: Def. José M. Arguedas (+2 puntos), Nacional FBC, Juventud Alfa y Melgar FBC.
Bajaron a la Copa Perú: Carlos Stein de Talara, Unión Santo Domingo de Nasca, Diablos Rojos de Juliaca y Rauker FC de Ucayali. Rauker FC no podrá participar por 2 años, por haber perdido la categoría en la Liga 3 por acumulación de walk over.
Grupos de la segunda fase
El formato será todos contra todos de cada grupo ida y vuelta en seis fechas. Los dos primeros clasificarán a los playoffs.
Grupo A: Unión Santo Domingo, Estudiantil CNI, Juventud Cautivo y Unión Huaral.
Grupo B: Universitario, Juventus FC, Alianza Lima y Deportivo Lute.
Grupo C: Construcción Civil, Nacional FBC, Sport Huancayo y FBC Melgar.
Grupo D: Def. José M. Arguedas, Nuevo San Cristóbal, Juventud Alfa FC y ADT Reserva.
