El nuevo formato de la Liga 3, que reemplazará prácticamente a la Copa Perú desde 2025, ha sido incluido en el calendario oficial de la Federación Peruana de Fútbol (FPF). Este torneo contará con la participación de 37 equipos representando a las 25 regiones del país, aunque finalmente serán 36, ya que el club Municipal de Lima se enfrentará previamente al Juan Aurich para definir su clasificación.
Los equipos serán organizados en cuatro grupos según su proximidad geográfica:
- Grupo A: Tumbes, Piura, Lambayeque, La Libertad, Cajamarca, Amazonas, San Martín y La Libertad (segundo clasificado).
- Grupo B: Áncash, Lima, Callao, Ica y Loreto.
- Grupo C: Ucayali, Huánuco, Pasco, Junín, Huancavelica y Ayacucho.
- Grupo D: Arequipa, Apurímac, Cusco, Madre de Dios, Puno, Moquegua y Tacna.
En la primera fase, los equipos jugarán un sistema de todos contra todos en partidos de ida y vuelta dentro de sus grupos. Los cuatro mejores de cada grupo avanzarán a la siguiente etapa, mientras que el último de cada serie descenderá.
En la segunda fase, los clasificados serán redistribuidos en grupos de cuatro equipos. Los dos mejores de cada serie progresarán a los playoffs, donde se definirá al campeón del torneo.
