En la Etapa Nacional 2018 los 50 clubes clasificados han disputado seis partidos cada uno, en los cuales se han destacado nuevos elementos que aparecen como eficaces ante las porterías. A continuación presentamos la relación de goleadores solo de la Etapa Nacional, sin contar los que pudieron marcar en la campaña 2018 desde la etapa distrital hasta la departamental.
En la relación de jugadores que marcaron por lo menos 5 goles no figura ningún huanuqueño, tanto de Alianza UDH como de León de Huánuco.
La relación es la siguiente:
Con 9 goles: Diego Escuza (Sportivo Huracán)
Con 8 goles: Yoffré Vásquez (Molinos El Pirata)
Con 7 goles: Jorge Esparza (El Inca de Chao)
Con 6 goles: Wilder Fernández (Bellavista FC), Giuliano Gamarra (Deportivo Robles).
Con 5 goles: Gino Ríos (Alfonso Ugarte), Raúl Cunya (Atlético Torino), Gonzalo Guadalupe (Credicoop San Román), Carlos Lazón (Social Venus)
