Las delegaciones de Huánuco no lograron clasificar a la etapa nacional de balonmano en los Juegos Escolares 2024, tras su participación en la etapa macro regional en Huancayo. En la categoría B (14 años), tanto el equipo masculino como el femenino quedaron fuera de competencia.
En la rama masculina, el equipo del Colegio San Luis Gonzaga finalizó como subcampeón, pero no consiguió avanzar debido a un triple empate con los equipos de Junín y Pasco. Aunque vencieron a Oxapampa por 11-4 y a Huancavelica por 4-1, el empate en la final contra Junín, en condiciones polémicas, los dejó fuera. Según el entrenador Carlos Cano, el partido se extendió 10 minutos más de lo reglamentario, permitiendo a Junín empatar cuando Huánuco ganaba por 2 goles.
En la rama femenina, el equipo del colegio Nuestra Señora de las Mercedes quedó en tercer lugar. Ganaron a Pasco por 4-1, pero cayeron ante Huancavelica y Junín.
